RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FMO1	Q01740	532 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDR2	Q01850	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOG	Q13253	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	BIRC3	Q13489	604 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CUL2	Q13617	745 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NCOA4	Q13772	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBR7	Q8N806	425 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CEP120	Q8N960	986 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIB2	Q92519	343 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBXN4	Q92575	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ASB7	Q9H672	318 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CES2	O00748	559 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TREH	O43280	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NCK2	O43639	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	AOC2	O75106	756 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHACTR2	O75167	634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTA2	O94776	668 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNNC2	P02585	160 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MME	P08473	750 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CXCL8	P10145	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GNAT1	P11488	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP2C9	P11712	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	AXL	P30530	894 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GMPR	P36959	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	USP8	P40818	1118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GRM5	P41594	1212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FLT3LG	P49771	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDE6C	P51160	858 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF132	P52740	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYL6	P60660	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	OSTN	P61366	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPC5	P78333	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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