RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF217Q8TC41 542 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHC3Q92529 594 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFT74Q96LB3 600 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDH16O75309 829 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRT36O76013 467 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GGPS1O95749 300 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GZMAP12544 262 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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RAPGEF6-211ENST00000512611 KLRC2P26717 231 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRKP46108 304 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NFIL3Q16649 462 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MSS51Q4VC12 460 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NACC1Q96RE7 527 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRABDQ9H4I3 376 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL20A1Q9P218 1284 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NRAPQ86VF7 1730 aa7.26□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBED4O75132 1171 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 HLA-DOAP06340 250 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRT15P19012 456 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRT4P19013 534 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SSTR1P30872 391 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPA2P48052 419 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRCA2P51587 3418 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCEAL1Q15170 157 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP55Q53EZ4 464 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRRC6Q86X45 466 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLF2Q8IX21 1173 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF276Q8N554 614 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATL2Q8NHH9 583 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCAF4Q8WV16 495 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 UMODL1Q5DID0 1318 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CFAP69A5D8W1 941 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNAT1P11488 350 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CA4P22748 312 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL9RQ01113 521 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 STRN3Q13033 797 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACVR2BQ13705 512 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF516Q92618 1163 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLCO2A1Q92959 643 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 NYAP2Q9P242 653 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARMCX1Q9P291 453 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYPNQ86TC9 1320 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0G2JND7 137 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLS3P13797 630 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPX6P59796 221 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 RINLQ6ZS11 566 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 SV2AQ7L0J3 742 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNJLQ8IV13 435 aa7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.257e-8■■■□□ 17.1
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