RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS39	Q96JC1	886 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RADIL	Q96JH8	1075 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CATSPER2	Q96P56	530 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TOMM22	Q9NS69	142 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EMC3	Q9P0I2	261 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MYH1	P12882	1939 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TNKS	O95271	1327 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC72	A6NJI9	287 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SPOP	O43791	374 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM13A	O94988	1023 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PDHA1	P08559	390 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MCM3	P25205	808 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MSX1	P28360	303 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	HNF4A	P41235	474 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GRK6	P43250	576 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCG1	P45844	678 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PHKA2	P46019	1235 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCD1	P51178	756 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NFIA	Q12857	509 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BBS9	Q3SYG4	887 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	C2orf27A	Q580R0	203 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATL3	Q6DD88	541 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KLC3	Q6P597	504 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NIM1K	Q8IY84	436 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N3U1	123 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FANCB	Q8NB91	859 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	POF1B	Q8WVV4	589 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	WASF1	Q92558	559 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TIFA	Q96CG3	184 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ART5	Q96L15	291 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TCF12	Q99081	682 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DESI2	Q9BSY9	194 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	VPS18	Q9P253	973 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EDAR	Q9UNE0	448 aa		7.24	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	COL4A5	P29400	1685 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NDUFAB1	O14561	156 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	AREL1	O15033	823 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	JAK2	O60674	1132 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DGKI	O75912	1065 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ASMTL	O95671	621 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	OLFM2	O95897	454 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FURIN	P09958	794 aa		7.23	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25

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