RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 CDH22Q9UJ99 828 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 NUB1Q9Y5A7 615 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ALADP13716 330 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 CYP3A5P20815 502 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ATAT1Q5SQI0 421 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PDXDC1Q6P996 788 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TMC5Q6UXY8 1006 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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CXCL3-202ENST00000502974 LOC730098B7Z3J9 87 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 IL18RAPO95256 599 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 WEE2P0C1S8 567 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 LRPAP1P30533 357 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 STK4Q13043 487 aa27.09■■□□□ 1.93
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CXCL3-202ENST00000502974 SPATA1Q5VX52 437 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 KANK3Q6NY19 840 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PALB2Q86YC2 1186 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PIK3R5Q8WYR1 880 aa27.09■■□□□ 1.93
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CXCL3-202ENST00000502974 DERAQ9Y315 318 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 DCXO43602 365 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 EXTL3O43909 919 aa27.08■■□□□ 1.93
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CXCL3-202ENST00000502974 DPYDQ12882 1025 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RNF135Q8IUD6 432 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GPD1LQ8N335 351 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0895Q8NCT3 520 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC34Q96HJ3 373 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 POMKQ9H5K3 350 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 TGFB1I1O43294 461 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 SP100P23497 879 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 C2CD2Q9Y426 696 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 NR2E1Q9Y466 385 aa27.07■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 MUTYHQ9UIF7 546 aa27.06■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa27.05■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 GPR149Q86SP6 731 aa27.05■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 SUSD3Q96L08 255 aa27.05■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 PPEF2O14830 753 aa27.04■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 CYP2J2P51589 502 aa27.04■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 DPP3Q9NY33 737 aa27.04■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 PNOCQ13519 176 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM31Q5JXX7 168 aa27.03■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 C9orf57Q5W0N0 161 aa27.03■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 PDE11AQ9HCR9 933 aa27.03■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa27.02■■□□□ 1.92
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CXCL3-202ENST00000502974 NT5DC4Q86YG4 428 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 PCDHB8Q9UN66 801 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 SCN1AP35498 2009 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 DENND4AQ7Z401 1863 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-202ENST00000502974 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.01■■□□□ 1.91
CXCL3-202ENST00000502974 RFPL2O75678 378 aa27.01■■□□□ 1.91
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