RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496372.1

CNIH3-212, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNIH3, Length 451 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-212ENST00000496372 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 INTS13Q9NVM9 706 aa8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 STK39Q9UEW8 545 aa8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 EYSQ5T1H1 3165 aa8.51□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 HIDE1A8MVS5 230 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PIRO00625 290 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TRAPPC3O43617 180 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ITGB3P05106 788 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 URODP06132 367 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CTSAP10619 480 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 KRT13P13646 458 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 GLUD2P49448 558 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 USP41Q3LFD5 358 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TMC2Q8TDI7 906 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PPM1EQ8WY54 764 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF516Q92618 1163 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CHST7Q9NS84 486 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 DACH1Q9UI36 760 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.5□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 C2CD2LO14523 706 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SPTLC1O15269 473 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 LILRB3O75022 631 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 KRT19P08727 400 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 FGFR3P22607 806 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 NRIP1P48552 1158 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TAF6P49848 677 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 VAMP7P51809 220 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 AP3M2P53677 418 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 LILRA4P59901 499 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 DLG4P78352 724 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CLDN10P78369 228 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RBP5P82980 135 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 DSG1Q02413 1049 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 HYAL1Q12794 435 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 BFSP1Q12934 665 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PTPN14Q15678 1187 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SV2CQ496J9 727 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RTP2Q5QGT7 225 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 USP37Q86T82 979 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CEP57Q86XR8 500 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CXorf38Q8TB03 319 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 BORCS6Q96GS4 357 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SUSD3Q96L08 255 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF560Q96MR9 790 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 CEP63Q96MT8 703 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 MED15Q96RN5 788 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TTPALQ9BTX7 342 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 IGFLR1Q9H665 355 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 TLE6Q9H808 572 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SIX4Q9UIU6 781 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 IRAK3Q9Y616 596 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 COL6A3P12111 3177 aa8.49□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.48□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 M0QZQ0 153 aa8.48□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 IKBKBO14920 756 aa8.48□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 SYN3O14994 580 aa8.48□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PER2O15055 1255 aa8.48□□□□□ -1.05
CNIH3-212ENST00000496372 PHACTR2O75167 634 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms