RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA31D3	P0C874	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PRCP	P42785	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	COL19A1	Q14993	1142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CEP135	Q66GS9	1140 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC1B	Q9P126	229 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	NCOR1	O75376	2440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ADAM12	O43184	909 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TNNC2	P02585	160 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ITGB3	P05106	788 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KRT19	P08727	400 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TNNI1	P19237	187 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	FGFR3	P22607	806 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CASP4	P49662	377 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ARPP19	P56211	112 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SURF1	Q15526	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CASP10	Q92851	521 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CD207	Q9UJ71	328 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		10.62	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PIR	O00625	290 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SPTLC1	O15269	473 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	GLUD1	P00367	558 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	NR2F2	P24468	414 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	OR1D2	P34982	312 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	TAF6	P49848	677 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CLCN4	P51793	760 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LILRA4	P59901	499 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CREM	Q03060	361 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	BFSP1	Q12934	665 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KCNC3	Q14003	757 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PSMD6	Q15008	389 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	USP37	Q86T82	979 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	FNIP2	Q9P278	1114 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CALD1-223	ENST00000496024	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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