RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493427.1

ABCD4-215, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-215	ENST00000493427	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TTC9	Q92623	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ITPKA	P23677	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC26A2	P50443	739 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GPC3	P51654	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PSMD5	Q16401	504 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	BRF1	Q92994	677 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GAD1	Q99259	594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CAPN10	Q9HC96	672 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427		E9PAM4	449 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ARHGAP33	O14559	1287 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	BACH1	O14867	736 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	ZNF623	O75123	536 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GJB3	O75712	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	EGF	P01133	1207 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PSMA5	P28066	241 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	CDC27	P30260	824 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RCAN1	P53805	252 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	NFKB2	Q00653	900 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TNK2	Q07912	1038 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SLC14A1	Q13336	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RTN1	Q16799	776 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-215	ENST00000493427	LRBA	P50851	2863 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	NID2	Q14112	1375 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PTPRD	P23468	1912 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	DKK1	O94907	266 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	SERPINF2	P08697	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	GJA1	P17302	382 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PTPN2	P17706	415 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	EVC	P57679	992 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	DSC1	Q08554	894 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	BLACE	A4D250	179 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	MEIS2	O14770	477 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-215	ENST00000493427	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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