RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SUFUQ9UMX1 484 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 WDR90Q96KV7 1748 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 E7EVH7 732 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 KIAA0754O94854 1291 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PIGRP01833 764 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PMS2P54278 862 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 IFT88Q13099 833 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PTGISQ16647 500 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CHADLQ6NUI6 762 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 GPC2Q8N158 579 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TCHPQ9BT92 498 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CHST7Q9NS84 486 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NRBP2Q9NSY0 501 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ADGRA2Q96PE1 1338 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PTPRFP10586 1907 aa13.71□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TLDC2A0PJX2 215 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ADCY3O60266 1144 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CAND2O75155 1236 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 GJB1P08034 283 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CLTAP09496 248 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NOP14P78316 857 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CYP1B1Q16678 543 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CGRRF1Q99675 332 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MTUS1Q9ULD2 1270 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 USTQ9Y2C2 406 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MCM3APO60318 1980 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 FSCN2O14926 492 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 FGFR4P22455 802 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 GNA15P30679 374 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 GJC1P36383 396 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NCOA4Q13772 614 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SLC29A2Q14542 456 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CLUL1Q15846 466 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MON1BQ7L1V2 547 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CEP57Q86XR8 500 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.7□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 THAP12O43422 761 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 EDNRBP24530 442 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R40P59535 323 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CENPCQ03188 943 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ZNF394Q53GI3 561 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SGO2Q562F6 1265 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NLRP14Q86W24 1093 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CCDC25Q86WR0 208 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 COPS5Q92905 334 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ADAM22Q9P0K1 906 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SOCS7O14512 581 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CD58P19256 250 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NOMO3P69849 1222 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 Q3C1V9 767 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MDM1Q8TC05 714 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CSADQ9Y600 493 aa13.69□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PODXLO00592 558 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MAFO75444 373 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 CNMDO75829 334 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 SSR1P43307 286 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 FNTAP49354 379 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 BPIFB4P59827 614 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 OSTNP61366 133 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ENPEPQ07075 957 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 E2F5Q15329 346 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R7Q15435 360 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 AGBL2Q5U5Z8 902 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MTMR12Q9C0I1 747 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 EVPLQ92817 2033 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MSCO60682 206 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 RFC5P40937 340 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MYL6P60660 151 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 MAMLD1Q13495 774 aa13.68□□□□□ -0.22
PRAME-213ENST00000492657 NEDD9Q14511 834 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms