RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 ZP2Q05996 745 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ZBTB6Q15916 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SPATA1Q5VX52 437 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KANK3Q6NY19 840 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 UBE4BO95155 1302 aa14.51□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 H7C4K7 107 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SYN3O14994 580 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 EXTL3O43909 919 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C1RP00736 705 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 WEE2P0C1S8 567 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PSMD2Q13200 908 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 GPD1LQ8N335 351 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 APPL2Q8NEU8 664 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SUSD6Q92537 303 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SUSD3Q96L08 255 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 DPP3Q9NY33 737 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C2CD2Q9Y426 696 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SCN1AP35498 2009 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ZNF233A6NK53 670 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 EHHADHQ08426 723 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 LIN9Q5TKA1 542 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 USP37Q86T82 979 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PIDD1Q9HB75 910 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CD320Q9NPF0 282 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 MTRRQ9UBK8 725 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 MYO10Q9HD67 2058 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CLIC2O15247 247 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KLRC4O43908 158 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PAX3P23760 479 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 HOXD13P35453 343 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CYP2J2P51589 502 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ARPP19P56211 112 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RAB33AQ14088 237 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 LILRA6Q6PI73 481 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 GPR149Q86SP6 731 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RDH13Q8NBN7 331 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CDH22Q9UJ99 828 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 NR2E1Q9Y466 385 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ADAM12O43184 909 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 RFPL2O75678 378 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KIF20AO95235 890 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 KCNA4P22459 653 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ELF1P32519 619 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 LILRA4P59901 499 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 STK4Q13043 487 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 SURF1Q15526 300 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 ZNF280DQ6N043 979 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCL28-202ENST00000489442 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms