RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 KLK7P49862 253 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 KCNA1Q09470 495 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CARNS1A5YM72 827 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 H7C4K7 107 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 IVLP07476 585 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 RALAP11233 206 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 KRT3P12035 628 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TFDP2Q14188 446 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CCL14Q16627 93 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 ALDH2P05091 517 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP5P24588 427 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 MYL6P60660 151 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 CYB561D2O14569 222 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 AMHP03971 560 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CDK17Q00537 523 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CROCCP2Q86T23 111 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 FAM200BP0CF97 657 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 OPLAHO14841 1288 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 CCNYQ8ND76 341 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CHST12Q9NRB3 414 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 ATF2P15336 505 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC1A1P43005 524 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF131P52739 623 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GALCP54803 685 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SNX17Q15036 470 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CDT1Q9H211 546 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ASTN1O14525 1302 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC66A2RUB6 948 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.77□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 HSPH1Q92598 858 aa8.77□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 ARL2P36404 184 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRD-211ENST00000486161 DYNLT1P63172 113 aa8.77□□□□□ -1.01
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