RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 TMX3Q96JJ7 454 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NACC1Q96RE7 527 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 BRD9Q9H8M2 597 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TUFT1Q9NNX1 390 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GMEB2Q9UKD1 530 aa12.9□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 COL4A2P08572 1712 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR27A2RRH5 827 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP11B2P19099 503 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TGM1P22735 817 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FCARP24071 287 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ELF1P32519 619 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NAMPTP43490 491 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM78AQ5JUQ0 283 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NT5DC1Q5TFE4 455 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ATF7IP2Q5U623 682 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 DNASE1L2Q92874 299 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 UROC1Q96N76 676 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MCM7P33993 719 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP2R5AQ15172 486 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CHRDQ9H2X0 955 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4F11Q9HBI6 524 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB23Q9ULC3 237 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MAN2B1O00754 1011 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ABLIM3O94929 683 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC24AO95486 1093 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TDGF1P13385 188 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GDI1P31150 447 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CCR2P41597 374 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 EFNA5P52803 228 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 OSTNP61366 133 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SPEM2Q0P670 501 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP120Q8N960 986 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 IFT74Q96LB3 600 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 RTKNQ9BST9 563 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPY26PQ9H489 355 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PODXLO00592 558 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF197O14709 1029 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 LARGE1O95461 756 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TPM3P06753 285 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ATF2P15336 505 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NRLP54845 237 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM29Q14134 588 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PRR23BQ6ZRT6 265 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ERMNQ8TAM6 284 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM3CQ92520 227 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 IRF7Q92985 503 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ASB16Q96NS5 453 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 LMAN1LQ9HAT1 526 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFHX4Q86UP3 3567 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ATG2BQ96BY7 2078 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MYH11P35749 1972 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 JAK2O60674 1132 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMC3P17980 439 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 RPA1P27694 616 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 VIPR2P41587 438 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP2R5DQ14738 602 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ME3Q16798 604 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 LAIR1Q6GTX8 287 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 VITQ6UXI7 678 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ELMOD1Q8N336 334 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCD2Q92925 531 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 GTF3C6Q969F1 213 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 PKNOX2Q96KN3 472 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 CDT1Q9H211 546 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-207ENST00000484547 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms