RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFD1LQ6UB35 978 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC20A1Q8WUM9 679 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM161BQ96MY7 647 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TXLNGYQ9BZA5 131 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM47DPA6NHR8 397 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 K7ENM7 598 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NFIBO00712 420 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC5A9Q2M3M2 681 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC125Q86Z20 511 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB12Q96P63 405 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PDXKO00764 312 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE6P0CI01 402 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SPARCL1Q14515 664 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CBWD6Q4V339 395 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CBWD3Q5JTY5 395 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CBWD5Q5RIA9 395 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP9Q7RTR0 991 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IL31RAQ8NI17 732 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FAM84AQ96KN4 292 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 COG5Q9UP83 839 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 IRGCQ6NXR0 463 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HIPK4Q8NE63 616 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ACP6Q9NPH0 428 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCNFP41002 786 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM253P0C7T8 217 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3CAP42336 1068 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PRELPP51888 382 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 EPHA7Q15375 998 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 RNF43Q68DV7 783 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CGB2Q6NT52 195 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OPTNQ96CV9 577 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OCEL1Q9H607 264 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC134Q9H6E4 229 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT8Q9NY28 637 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GAS8O95995 478 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ACADSP16219 412 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DBN1Q16643 649 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL23Q8NBE8 558 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MBOAT7Q96N66 472 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP2BQ9UQN3 213 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TBX3O15119 743 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ENTPD3O75355 529 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PTGIRP43119 386 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 DLG4P78352 724 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TMED1Q13445 227 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MIER3Q7Z3K6 550 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SEC14L1Q92503 715 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 ZBED4O75132 1171 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CDH16O75309 829 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TTC4O95801 387 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GCLMP48507 274 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 LBRQ14739 615 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 GRAMD1AQ96CP6 724 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 HIC2Q96JB3 615 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 TRABDQ9H4I3 376 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 PREBQ9HCU5 417 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 WASF2Q9Y6W5 498 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SLX4Q8IY92 1834 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA13PA6NCF6 341 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-204ENST00000483092 SMAPO00193 183 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms