RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482158.1

SF3B1-210, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene SF3B1, Length 772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-210ENST00000482158 ARFIP2P53365 341 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 KIF22Q14807 665 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 APIPQ96GX9 242 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 NEU1Q99519 415 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 RSAD1Q9HA92 442 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.15□□□□□ -1.26
SF3B1-210ENST00000482158 CDHR4A6H8M9 788 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 LEFTY2O00292 366 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 TBX3O15119 743 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GJB1P08034 283 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ALAS1P13196 640 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 SCNN1GP51170 649 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CHN2P52757 468 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 SOX8P57073 446 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MED25Q71SY5 747 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MNTQ99583 582 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 BDH2Q9BUT1 245 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 BRD9Q9H8M2 597 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.14□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ITGB1P05556 798 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PIK3CBP42338 1070 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 SLFN5Q08AF3 891 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PICALMQ13492 652 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NFIXQ14938 502 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PDSS2Q86YH6 399 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 FITM2Q8N6M3 262 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 TMIEQ8NEW7 156 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PGBD4Q96DM1 585 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 DPH1Q9BZG8 443 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 RLIMQ9NVW2 624 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 POGKQ9P215 609 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.13□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 XDHP47989 1333 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CCDC78A2IDD5 438 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 E9PLN8 166 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MGEA5O60502 916 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PEX14O75381 377 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 AGFG2O95081 481 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MYL3P08590 195 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MGAT1P26572 445 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 SLC7A1P30825 629 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NOMO3P69849 1222 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 HHEXQ03014 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 EDAQ92838 391 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PHKBQ93100 1093 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GPR87Q9BY21 358 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GPR35Q9HC97 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 STK32BQ9NY57 414 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CFAP97Q9P2B7 532 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 MED16Q9Y2X0 877 aa7.12□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 ISM1B1AKI9 464 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GNAI3P08754 354 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 RARBP10826 455 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GCSHP23434 173 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 TM4SF4P48230 202 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 GNAI1P63096 354 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 FMO1Q01740 532 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 NHLH2Q02577 135 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CNGA2Q16280 664 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 SESTD1Q86VW0 696 aa7.11□□□□□ -1.27
SF3B1-210ENST00000482158 CXorf38Q8TB03 319 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms