RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	TFF2	Q03403	129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DUSP6	Q16828	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	HLA-C	Q95604	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DPP3	Q9NY33	737 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DERA	Q9Y315	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	C2CD2	Q9Y426	696 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TRANK1	O15050	2925 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	LILRB3	O75022	631 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TBX10	O75333	385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	GLP2R	O95838	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	BMP6	P22004	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KCNA5	P22460	613 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	NR2F2	P24468	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	NDUFV1	P49821	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DSG1	Q02413	1049 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	MORC3	Q14149	939 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CLUL1	Q15846	466 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	EFHB	Q8N7U6	833 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.11	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	MYO9B	Q13459	2157 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	SPTLC1	O15269	473 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TEX28	O15482	410 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ITGB3	P05106	788 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KRT19	P08727	400 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	FGFR3	P22607	806 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KLRC2	P26717	231 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ADAM15	Q13444	863 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PSMD6	Q15008	389 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PSMD5	Q16401	504 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	FNBP1	Q96RU3	617 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.1	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	ANO9	A1A5B4	782 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PIR	O00625	290 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	PSMA7	O14818	248 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	NCK2	O43639	380 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	AKAP3	O75969	853 aa		11.09	□□□□□ -0.63
HDAC6-222	ENST00000478095	TNNC2	P02585	160 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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