RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473584.1

SCP2-208, Transcript of sterol carrier protein 2, human

TSL 2

Gene SCP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCP2-208	ENST00000473584	CASR	P41180	1078 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TRAPPC10	P48553	1259 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	APBA1	Q02410	837 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	DACT2	Q5SW24	774 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	EMC10	Q5UCC4	262 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ANO1	Q5XXA6	986 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	AFMID	Q63HM1	303 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	RABGGTA	Q92696	567 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	RLIM	Q9NVW2	624 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584		B5MCH6	92 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SLC26A4	O43511	780 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	IL18RAP	O95256	599 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ALAS1	P13196	640 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ATP5J	P18859	108 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FPR1	P21462	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	STT3A	P46977	705 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF543	Q08ER8	600 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ERAP2	Q6P179	960 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PPCS	Q9HAB8	311 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	POM121B	A6NF01	834 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TBX3	O15119	743 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	GRM6	O15303	877 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PJA2	O43164	708 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	KCNJ5	P48544	419 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SOX8	P57073	446 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	DAG1	Q14118	895 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SPRED1	Q7Z699	444 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	POF1B	Q8WVV4	589 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PPM1E	Q8WY54	764 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ARL8A	Q96BM9	186 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	VPS11	Q9H270	941 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	MED16	Q9Y2X0	877 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PATE3	B3GLJ2	98 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	B4GALT4	O60513	344 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	GNAI2	P04899	355 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TSHR	P16473	764 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	RAC3	P60763	192 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ADAM8	P78325	824 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FMO1	Q01740	532 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TNFAIP2	Q03169	654 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TBR1	Q16650	682 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	CCDC93	Q567U6	631 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	KLC2	Q9H0B6	622 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	FNIP2	Q9P278	1114 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	SRRD	Q9UH36	339 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SCP2-208	ENST00000473584	USP19	O94966	1318 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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