RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CYP2J2P51589 502 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MYBPC2Q14324 1141 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PSMD5Q16401 504 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 APPL2Q8NEU8 664 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.19■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 EXOC3O60645 756 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GLUD1P00367 558 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 BRCC3P46736 316 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CLCN4P51793 760 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.18■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ANO9A1A5B4 782 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PIRO00625 290 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PNPLA4P41247 253 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 FNBP1Q96RU3 617 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.17■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ANK1P16157 1881 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 H7C4K7 107 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 I3L4J1 428 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 M0QZQ0 153 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 NR3C1P04150 777 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 KCNQ1P51787 676 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GUCY2FP51841 1108 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 LILRA4P59901 499 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 NFIL3Q16649 462 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 WDR49Q8IV35 697 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 RDH13Q8NBN7 331 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ZNF560Q96MR9 790 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 DMAC2Q9NW81 257 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MTRRQ9UBK8 725 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 TNNC2P02585 160 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 BMP1P13497 986 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 ITIH3Q06033 890 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 CYP24A1Q07973 514 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PSMD6Q15008 389 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 INTS13Q9NVM9 706 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
NOM1-203ENST00000469271 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 EPCAMP16422 314 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 PPP1R2P41236 205 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 TAF6P49848 677 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 WNT7BP56706 349 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 STIM1Q13586 685 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 CLUL1Q15846 466 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 SV2CQ496J9 727 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 USP37Q86T82 979 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 VCANP13611 3396 aa22.14■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 MBTPS2O43462 519 aa22.13■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 ODC1P11926 461 aa22.13■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 TNNI1P19237 187 aa22.13■■□□□ 1.13
NOM1-203ENST00000469271 TYMPP19971 482 aa22.13■■□□□ 1.13
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