RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 WEE2P0C1S8 567 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 LRPAP1P30533 357 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GPD1LQ8N335 351 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PIDD1Q9HB75 910 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 NR2E1Q9Y466 385 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 C5orf42Q9H799 3197 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SCN1AP35498 2009 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 EXTL3O43909 919 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 OR1D2P34982 312 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GUCY2FP51841 1108 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA1Q5VX52 437 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 USP37Q86T82 979 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SUSD6Q92537 303 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 C2CD2Q9Y426 696 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.21■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF202O95125 648 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ARPP19P56211 112 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PSMD2Q13200 908 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB6Q15916 424 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KANK3Q6NY19 840 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SUSD3Q96L08 255 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 DPP3Q9NY33 737 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 MTRRQ9UBK8 725 aa22.2■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF233A6NK53 670 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 C1RP00736 705 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ADRB2P07550 413 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF280DQ6N043 979 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.19■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CLIC2O15247 247 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KIF20AO95235 890 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ELF1P32519 619 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CYP2J2P51589 502 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SURF1Q15526 300 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 GPR149Q86SP6 731 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF560Q96MR9 790 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 POMKQ9H5K3 350 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CDH22Q9UJ99 828 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.18■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ODC1P11926 461 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 PAX3P23760 479 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CD320Q9NPF0 282 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 POLIQ9UNA4 740 aa22.17■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 RFPL2O75678 378 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 KRT19P08727 400 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CPB1P15086 417 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 TAF6P49848 677 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 EHHADHQ08426 723 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 RAB33AQ14088 237 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.16■■□□□ 1.14
SCAF8-204ENST00000461219 METTL23Q86XA0 190 aa22.16■■□□□ 1.14
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