RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC27Q6P3X3 843 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PLPP6Q8IY26 295 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CORO1BQ9BR76 489 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GANQ9H2C0 597 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP2Q9UGN5 583 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F6O75461 281 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB4P21439 1286 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DSG1Q02413 1049 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LMNB2Q03252 620 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KLC3Q6P597 504 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS52Q8N1B4 723 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf82Q8WW14 230 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CYTH2Q99418 400 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 COA1Q9GZY4 146 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GYG2O15488 501 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GSC2O15499 205 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF2O75151 1096 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PYGMP11217 842 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA6P17066 643 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A1P19634 815 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 AMPD1P23109 780 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TECP42680 631 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GALCP54803 685 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM5Q71RC9 77 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SV2BQ7L1I2 683 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF384Q8TF68 577 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG3Q92685 438 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FNBP1Q96RU3 617 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 INIPQ9NRY2 104 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SCN9AQ15858 1988 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRG0 241 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC160A6NGH7 325 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF10BO14763 440 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC22O60826 627 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DDAH1O94760 285 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CETPP11597 493 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FOSL1P15407 271 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MLH1P40692 756 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ1P48048 391 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC1P48995 793 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SULT2A1Q06520 285 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KYNUQ16719 465 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PRELID2Q8N945 189 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf50Q8WW18 174 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SMC6Q96SB8 1091 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ECSITQ9BQ95 431 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MRGBPQ9NV56 204 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PODXLO00592 558 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PGM3O95394 542 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ASMTLO95671 621 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 BAG2O95816 211 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL1O95922 423 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1R1P14778 569 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms