RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.86■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 K7ENM7 598 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 FESP07332 822 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PCK1P35558 622 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 VPS41P49754 854 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CDR2Q01850 454 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CENPCQ03188 943 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPARCL1Q14515 664 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRABD2AQ86V40 505 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LONP2Q86WA8 852 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM206Q9H813 350 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DPPA5A6NC42 116 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PMM2O15305 246 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 AHCYL1O43865 530 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 T-ENOLP0DO92 83 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CYP11B1P15538 503 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RRM1P23921 792 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLC18A1P54219 525 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MFAP3P55082 362 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYAQ5MJ70 313 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CPXCR1Q8N123 301 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DAW1Q8N136 415 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK4P31152 587 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TRAF1Q13077 416 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC89Q8N998 374 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM117Q9H0C3 514 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.85■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TISP43B9A030 160 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG7O75391 227 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ACADSP16219 412 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PDK4Q16654 411 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF365Q70YC5 407 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPOCK2Q92563 424 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LXNQ9BS40 222 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CNTNAP1P78357 1384 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LRRD1A4D1F6 860 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 NEFHP12036 1026 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EPHB2P29323 1055 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ALCAMQ13740 583 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TTLL6Q8N841 843 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO41Q8TF61 875 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf82Q8WW14 230 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.84■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEA4P43358 317 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF449Q6P9G9 518 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB10Q96DT7 871 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 TEKT3Q9BXF9 490 aa15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 130.3
TOP3B-206ENST00000436282 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.13
TOP3B-206ENST00000436282 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 INHBEP58166 350 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 DGKZQ13574 1117 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 TDRPQ86YL5 185 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC8CQ8TDW0 803 aa15.83■□□□□ 0.12
TOP3B-206ENST00000436282 ACCSQ96QU6 501 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms