RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRIG3Q6UXM1 1119 aa26.96■■□□□ 1.91
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ASS1P00966 412 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.93■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.92■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa26.91■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF132P52740 706 aa26.91■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 IGBP1P78318 339 aa26.91■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.91■■□□□ 1.9
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PLEKHF1-201ENST00000436066 SKOR1P84550 965 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF844Q08AG5 666 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEP120Q8N960 986 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 RUNDC3BQ96NL0 473 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 CENPHQ9H3R5 247 aa26.9■■□□□ 1.9
PLEKHF1-201ENST00000436066 MINDY3Q9H8M7 445 aa26.9■■□□□ 1.9
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