RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB20Q9NX57 234 aa11.05□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.05□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTPRJQ12913 1337 aa11.05□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTGESO14684 152 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAX3P23760 479 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC25BP30305 580 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNNC1P63316 161 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB103AP81534 67 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NR1I3Q14994 352 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SV2CQ496J9 727 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TET1Q8NFU7 2136 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASD1Q96PB1 797 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.04□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTC3P53804 2025 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CASTOR2A6NHX0 329 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PODXLO00592 558 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEX33O43247 280 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DGKIO75912 1065 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRPAP1P30533 357 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAF6P49848 677 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB6Q15916 424 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPC2Q52LR7 807 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMC6Q7Z403 805 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VSTM4Q8IW00 320 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF516Q92618 1163 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VWCEQ96DN2 955 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HPDLQ96IR7 371 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AAASQ9NRG9 546 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APEX2Q9UBZ4 518 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INSL6Q9Y581 213 aa11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANK1P16157 1881 aa11.02□□□□□ -0.64
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAPPC3O43617 180 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TLL1O43897 1013 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GJB5O95377 273 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAG3P18627 525 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PON1P27169 355 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR1G1P47890 313 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUCY2FP51841 1108 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPHB4P54760 987 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFAP3P55082 362 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYL6P60660 151 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRMPQ12912 555 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HERC6Q8IVU3 1022 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTC39CQ8N584 583 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPAG5Q96R06 1193 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM175Q9BSA9 504 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNF19AQ9NV58 838 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIX4Q9UIU6 781 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms