RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429270.1

BBX-210, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-210ENST00000429270 ARMT1Q9H993 441 aa6.97□□□□□ -1.29
BBX-210ENST00000429270 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
BBX-210ENST00000429270 L1RE1Q9UN81 338 aa6.97□□□□□ -1.29
BBX-210ENST00000429270 POLHQ9Y253 713 aa6.97□□□□□ -1.29
BBX-210ENST00000429270 USP47Q96K76 1375 aa6.96□□□□□ -1.29
BBX-210ENST00000429270 CYP27B1O15528 508 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 HMGCRP04035 888 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 C3orf20Q8ND61 904 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PIGBQ92521 554 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RAB24Q969Q5 203 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SGPP1Q9BX95 441 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DMTF1Q9Y222 760 aa6.96□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 A0A1W2PP64 1363 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 A0A1W2PR48 441 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 H3BUI4 141 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SGTAO43765 313 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TMEM127O75204 238 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 KNG1P01042 644 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 LIMS1P48059 325 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 MEOX1P50221 254 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DLG4P78352 724 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GPSM2P81274 684 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 CDC42EP1Q00587 391 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SNX33Q8WV41 574 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 NOX5Q96PH1 765 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TBCBQ99426 244 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 KCNK12Q9HB15 430 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.95□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 ARIH2O95376 493 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GAAP10253 952 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 COL6A1P12109 1028 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SLC5A1P13866 664 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SYN1P17600 705 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SERPINB3P29508 390 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RAB1AP62820 205 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 DSC2Q02487 901 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 NOGQ13253 232 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 FGL2Q14314 439 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SEPT2Q15019 361 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 UBE3CQ15386 1083 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SMIM5Q71RC9 77 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 ZNF480Q8WV37 535 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TMX3Q96JJ7 454 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 CCDC138Q96M89 665 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TLR9Q9NR96 1032 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.94□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 USP54Q70EL1 1684 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 ATP10DQ9P241 1426 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SMARCA1P28370 1054 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 HK3P52790 923 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 TGFB2P61812 414 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 STK3Q13188 491 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PRR31Q5SQ13 230 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 PGBD4Q96DM1 585 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SLC35A4Q96G79 324 aa6.93□□□□□ -1.3
BBX-210ENST00000429270 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms