RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOC1Q9NV70 894 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 C2CD2Q9Y426 696 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SYN3O14994 580 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAM12O43184 909 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 WEE2P0C1S8 567 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 STK4Q13043 487 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 GPD1LQ8N335 351 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MTRRQ9UBK8 725 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH22Q9UJ99 828 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE4BO95155 1302 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1D2P34982 312 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 DPP3Q9NY33 737 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF233A6NK53 670 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PIRO00625 290 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PPEF2O14830 753 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIC2O15247 247 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR29P0C7W0 189 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MTHFRP42898 656 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT7BP56706 349 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 DPYDQ12882 1025 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB33AQ14088 237 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR149Q86SP6 731 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 APPL2Q8NEU8 664 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC28Q96AY4 2481 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO9A1A5B4 782 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C4K7 107 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 M0QZQ0 153 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 LILRA4P59901 499 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIP11Q15643 1979 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D4O60343 1298 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RFPL2O75678 378 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PAX3P23760 479 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RDH13Q8NBN7 331 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 POMKQ9H5K3 350 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SPTLC1O15269 473 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOBTB3O94955 611 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2J2P51589 502 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPP19P56211 112 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 SENP8Q96LD8 212 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.82■■□□□ 1.24
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