RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.13□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ARID3AQ99856 593 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 AGPAT1Q99943 283 aa7.13□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 INTUQ9ULD6 942 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GINS2Q9Y248 185 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ATP8B3O60423 1300 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 LCTP09848 1927 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GUA9 196 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ANO9A1A5B4 782 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 M0QZ92 97 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GPR25O00155 361 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GPR32O75388 356 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 VNN1O95497 513 aa7.12□□□□□ -1.27
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