RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM153CQ494X1 144 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP58Q5T655 872 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.54■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 PODXLO00592 558 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 TTI1O43156 1089 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 DR1Q01658 176 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 TNFAIP2Q03169 654 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 IRF5Q13568 498 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR3Q13615 1198 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB33Q86T24 672 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM84AQ96KN4 292 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 BTBD19C9JJ37 291 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 PPFIA4O75335 1185 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MAN1A1P33908 653 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FNTAP49354 379 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 NAA35Q5VZE5 725 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ERP44Q9BS26 406 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.53■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MYO1FO00160 1098 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 TNNC2P02585 160 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MCF2P10911 925 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 RRM1P23921 792 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 MARCKSL1P49006 195 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 CCL15Q16663 113 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 DUPD1Q68J44 220 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 NLRP4Q96MN2 994 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 ZIM3Q96PE6 472 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 RNPEPQ9H4A4 650 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 NR2E1Q9Y466 385 aa21.52■■□□□ 1.04
SUMO3-204ENST00000411651 PROSCO94903 275 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PYGMP11217 842 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 INSRRP14616 1297 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TMOD1P28289 359 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TRPC3Q13507 836 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 GRB14Q14449 540 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PRELID2Q8N945 189 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 SLCO2A1Q92959 643 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CDT1Q9H211 546 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 A6NNZ2 444 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CLCN3P51790 818 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TRADDQ15628 312 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 SEZ6Q53EL9 994 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.51■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 FSCN2O14926 492 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 THAP12O43422 761 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PSTPIP1O43586 416 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 JAMLQ86YT9 394 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC19Q9H756 370 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 PARP2Q9UGN5 583 aa21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 DAPK3O43293 454 aa21.49■■□□□ 1.03
SUMO3-204ENST00000411651 CALB1P05937 261 aa21.49■■□□□ 1.03
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