RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 UBR7Q8N806 425 aa21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.8■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KRT86O43790 486 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KRT19P08727 400 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CD52P31358 61 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KIF5AQ12840 1032 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 NAB2Q15742 525 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 USP38Q8NB14 1042 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 AGPAT1Q99943 283 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 APOL6Q9BWW8 343 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ACP6Q9NPH0 428 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 DPP3Q9NY33 737 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 SCN1AP35498 2009 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 FANCGO15287 622 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CYP11B1P15538 503 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ATICP31939 592 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 GUCY2FP51841 1108 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PAK2Q13177 524 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.79■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ATP8B3O60423 1300 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KIF5CO60282 957 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KRT5P13647 590 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ASPAP45381 313 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 GNG11P61952 73 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.78■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CLSTN1O94985 981 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KCNE1P15382 129 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CHRNB2P17787 502 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 DSC3Q14574 896 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 WDR24Q96S15 920 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PARP2Q9UGN5 583 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 TNFAIP3P21580 790 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PDE6CP51160 858 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 RBP5P82980 135 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PALB2Q86YC2 1186 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KIF18AQ8NI77 898 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CAGE1Q8TC20 777 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF592Q92610 1267 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF333Q96JL9 665 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 KLK14Q9P0G3 267 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 DNAI1Q9UI46 699 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa21.77■■□□□ 1.08
HDDC3-202ENST00000394272 MYH10P35580 1976 aa21.77■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 MGEA5O60502 916 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 CD4P01730 458 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF132P52740 706 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 MBTPS1Q14703 1052 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM270Q6UE05 265 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 BCO2Q9BYV7 579 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 FMO1Q01740 532 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 CDR2Q01850 454 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 BEST2Q8NFU1 509 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 HPDLQ96IR7 371 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 POLIQ9UNA4 740 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF623O75123 536 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 BPIFB4P59827 614 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 CISHQ9NSE2 258 aa21.75■■□□□ 1.07
HDDC3-202ENST00000394272 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms