RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 NRP1O14786 923 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PHACTR2O75167 634 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SERPINC1P01008 464 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 HLA-DRAP01903 254 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 OR1G1P47890 313 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 BCAR1P56945 870 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 NCOA4Q13772 614 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 EPC2Q52LR7 807 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GTH6 734 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 AP5Z1O43299 807 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ITGB1P05556 798 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CA3P07451 260 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TPM2P07951 284 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 MYL6P60660 151 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 RBP5P82980 135 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CRACR2AQ9BSW2 395 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 LINC01553A4QN01 128 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 P4HA2O15460 535 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 KIF4AO95239 1232 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PIK3CAP42336 1068 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SPRED2Q7Z698 418 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 LMO3Q8TAP4 145 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 MARCH5Q9NX47 278 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 RAB20Q9NX57 234 aa25.37■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TEX33O43247 280 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ALDH2P05091 517 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 LAG3P18627 525 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TRPC3Q13507 836 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 HASPINQ8TF76 798 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 IFNKQ9P0W0 207 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.36■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SPTLC1O15269 473 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 B3GAT3O94766 335 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 UBASH3AP57075 661 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF558Q96NG5 402 aa25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 LILRA4P59901 499 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 UBXN1Q04323 297 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 NR1I3Q14994 352 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PTPN21Q16825 1174 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 UVSSAQ2YD98 709 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 HPDLQ96IR7 371 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 GCNT4Q9P109 453 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 VWA8A3KMH1 1905 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ASS1P00966 412 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 KCNMA1Q12791 1236 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF560Q96MR9 790 aa25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CDH23Q9H251 3354 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1W2PPC1 479 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 FSD2A1L4K1 749 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SLC9A1P19634 815 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TAF6P49848 677 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 PLCB2Q00722 1185 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 TAP1Q03518 808 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 CETN1Q12798 172 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 RAB30Q15771 203 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SARM1Q6SZW1 724 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 GBP6Q6ZN66 633 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 COLEC11Q9BWP8 271 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PDSS1-201ENST00000376215 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PDSS1-201ENST00000376215 PON1P27169 355 aa25.32■■□□□ 1.64
PDSS1-201ENST00000376215 ATICP31939 592 aa25.32■■□□□ 1.64
PDSS1-201ENST00000376215 PNPLA4P41247 253 aa25.32■■□□□ 1.64
PDSS1-201ENST00000376215 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
PDSS1-201ENST00000376215 APBA1Q02410 837 aa25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms