RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 MYO1DO94832 1006 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PCSK1P29120 753 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ACADSBP45954 432 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB4P48594 390 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA21Q7Z572 469 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.31■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SGSM3Q96HU1 749 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RSAD1Q9HA92 442 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFRBP09619 1106 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ANO4Q32M45 955 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINB9P50453 376 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN1Q05586 938 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ANO5Q75V66 913 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 JAMLQ86YT9 394 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TADA2AO75478 443 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EFHBQ8N7U6 833 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PAK5Q9P286 719 aa21.3■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SPAG6O75602 509 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CTSHP09668 335 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KLRC1P26715 233 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2C9P11712 490 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GFAPP14136 432 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA2P16389 499 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ECT2Q9H8V3 914 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC6O75061 913 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 DDIASQ8IXT1 998 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 TRADDQ15628 312 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 HACL1Q9UJ83 578 aa21.29■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CYBBP04839 570 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA1Q09470 495 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8RI6L899 631 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KA5O75582 802 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RBP3P10745 1247 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MSH4O15457 936 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PTK2BQ14289 1009 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LAMB3Q13751 1172 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A7Q8TE54 656 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.28■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MCF2P10911 925 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PTPAQ15257 358 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SV2CQ496J9 727 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA18Q8TC71 538 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 KCNB2Q92953 911 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 MTBPQ96DY7 904 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 EHD2Q9NZN4 543 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ERP44Q9BS26 406 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CARD9Q9H257 536 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 DYRK4Q9NR20 520 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SNX5Q9Y5X3 404 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ICAM1P05362 532 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 WEE2P0C1S8 567 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA4P13612 1032 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 CPS1P31327 1500 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LAMC2Q13753 1193 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PDK1Q15118 436 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.27■■□□□ 1
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms