RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 GRM2Q14416 872 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 BBOF1Q8ND07 529 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 NUP85Q9BW27 656 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 EBF3Q9H4W6 596 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 KCNK13Q9HB14 408 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 NDE1Q9NXR1 346 aa23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PPM1 405 aa23.01■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 LMO3Q8TAP4 145 aa23.01■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 MPP4Q96JB8 637 aa23.01■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23.01■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 ABCD1P33897 745 aa23■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 HPCAP84074 193 aa23■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 NEDD1Q8NHV4 660 aa23■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 TRIM49P0CI25 452 aa23■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 TRIM49CP0CI26 452 aa23■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 ADRA1DP25100 572 aa23■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 TMEM62Q0P6H9 643 aa23■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 DNM3Q9UQ16 869 aa22.99■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 A0A0J9YVX5 310 aa22.99■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.99■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 ZBTB16Q05516 673 aa22.98■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.98■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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OPN3-201ENST00000366554 TTC1Q99614 292 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.98■■□□□ 1.27
OPN3-201ENST00000366554 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.98■■□□□ 1.27
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