RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 SIX4Q9UIU6 781 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE8P0CG41 777 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GPC5P78333 572 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 UBR7Q8N806 425 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TAF4BQ92750 862 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 MAP2K2P36507 400 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CD302Q8IX05 232 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 C2CD2Q9Y426 696 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ITGB3P05106 788 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ASGR1P07306 291 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 KCNA10Q16322 511 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TEX35Q5T0J7 233 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CXorf38Q8TB03 319 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 COG1Q8WTW3 980 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PSMB7Q99436 277 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CISHQ9NSE2 258 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SNTG2Q9NY99 539 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 HMGCRP04035 888 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GNA15P30679 374 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CXCR5P32302 372 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 ASPAP45381 313 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CREG2Q8IUH2 290 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 MMS19Q96T76 1030 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-201ENST00000331803 WEE2P0C1S8 567 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CD58P19256 250 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF132P52740 706 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 TUBB4BP68371 445 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 DAAM2Q86T65 1068 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 HTTP42858 3142 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ATICP31939 592 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 VEGFBP49765 207 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 TCEAL1Q15170 157 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CAGE1Q8TC20 777 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RAET1EQ8TD07 263 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RABGGTAQ92696 567 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 KIF12Q96FN5 646 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 COG5Q9UP83 839 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 HES2Q9Y543 173 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KA1Q15418 735 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RSPH3Q86UC2 560 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 DPP3Q9NY33 737 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 POLIQ9UNA4 740 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CITO14578 2027 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 M0QZ92 97 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 THAP12O43422 761 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 PEX26Q7Z412 305 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 SNX27Q96L92 541 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-201ENST00000331803 DERAQ9Y315 318 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.3 ms