RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.7□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FSBPO95073 299 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TNNI1P19237 187 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MAMLD1Q13495 774 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 QPCTQ16769 361 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PPME1Q9Y570 386 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CNTN2Q02246 1040 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO40Q9UH90 709 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 K7ERI5 159 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ABLIM1O14639 778 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ADCY3O60266 1144 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ITIH2P19823 946 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 FGFR4P22455 802 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ZPBP2Q6X784 338 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 BRSK2Q8IWQ3 736 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 DEPTORQ8TB45 409 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 O00370 1275 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SORBS3O60504 671 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 DRD4P21917 467 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GNA15P30679 374 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EVPLQ92817 2033 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MSCO60682 206 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TAS2R40P59535 323 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ODF2Q5BJF6 829 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RELL1Q8IUW5 271 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SNF8Q96H20 258 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 AZI2Q9H6S1 392 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 BTBD7Q9P203 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB7AO95365 584 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 AP3M2P53677 418 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 KAT2BQ92831 832 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 GGA3Q9NZ52 723 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SCINQ9Y6U3 715 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 SOWAHBA6NEL2 793 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 DRP2Q13474 957 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CCNG2Q16589 344 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TREML2Q5T2D2 321 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM270Q6UE05 265 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 WDR49Q8IV35 697 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 EXD1Q8NHP7 514 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MTFR1LQ9H019 292 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 TCEA3O75764 348 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MMP8P22894 467 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CHKAP35790 457 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 CAV1Q03135 178 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 PPP1R7Q15435 360 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C2CD6Q53TS8 623 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 LIN9Q5TKA1 542 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 MDM1Q8TC05 714 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4C-201ENST00000317868 C11orf70Q9BRQ4 267 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms