RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317419.7

RABGAP1-201, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 2,186 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-201ENST00000317419 CARNS1A5YM72 827 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TEX33O43247 280 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 UBASH3AP57075 661 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 FIBCD1Q8N539 461 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TAF4BQ92750 862 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 IFNKQ9P0W0 207 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LCHNA4D1U4 455 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 EFEMP2O95967 443 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PBX1P40424 430 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 RABGGTBP53611 331 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 BCAR1P56945 870 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GBP6Q6ZN66 633 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 A0A1W2PPC1 479 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 NRP1O14786 923 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PHACTR2O75167 634 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LRRN2O75325 713 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ALDH2P05091 517 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LAG3P18627 525 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PNPLA4P41247 253 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 MYL6P60660 151 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CETN1Q12798 172 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 MARCH5Q9NX47 278 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 KIAA1671Q9BY89 1806 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CEP290O15078 2479 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PIK3CAP42336 1068 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TRPC3Q13507 836 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 A0A1W2PQC6 194 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PON1P27169 355 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 UBXN1Q04323 297 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ZNF560Q96MR9 790 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GBF1Q92538 1859 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LINC01553A4QN01 128 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SPTLC1O15269 473 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CBFA2T2O43439 604 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 KIF4AO95239 1232 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 KRT19P08727 400 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 OR1G1P47890 313 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 LILRA4P59901 499 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 HPDLQ96IR7 371 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SIX2Q9NPC8 291 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GCNT4Q9P109 453 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 MYOGP15173 224 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SLC9A1P19634 815 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TAF6P49848 677 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ZNF558Q96NG5 402 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PBX4Q9BYU1 374 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 F8W810 466 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ARHGEF15O94989 841 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ITGB1P05556 798 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 GSE1Q14687 1217 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 RABGGTAQ92696 567 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 B3GAT3O94766 335 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 MYO1EQ12965 1108 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 RAB30Q15771 203 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 ZNF699Q32M78 642 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SV2CQ496J9 727 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 AAASQ9NRG9 546 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGAP1-201ENST00000317419 SCN1AP35498 2009 aa20.33■□□□□ 0.84
RABGAP1-201ENST00000317419 KPNA7A9QM74 516 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms