RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 GYPCP04921 128 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CASP14P31944 242 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 BMPR1AP36894 532 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PBX3P40426 434 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 BCAR1P56945 870 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TUSC3Q13454 348 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SYCP1Q15431 976 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NAB2Q15742 525 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 EPC2Q52LR7 807 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 JADE1Q6IE81 842 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 KCNT2Q6UVM3 1135 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TMTC1Q8IUR5 882 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 REXO1L1PQ8IX06 675 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 COLGALT2Q8IYK4 626 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 RDH13Q8NBN7 331 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF558Q96NG5 402 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NUP58Q9BVL2 599 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CERS4Q9HA82 394 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CDH23Q9H251 3354 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CARNS1A5YM72 827 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NFICP08651 508 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 OR1G1P47890 313 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SLC11A1P49279 550 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CASP4P49662 377 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 WNT7BP56706 349 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CYP24A1Q07973 514 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ADAM9Q13443 819 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM132DQ14C87 1099 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PLVAPQ9BX97 442 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 DERAQ9Y315 318 aa12.88□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CASTOR2A6NHX0 329 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CETN3O15182 167 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 XPOTO43592 962 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 GALTP07902 379 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC175P0C221 793 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PPM1AP35813 382 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SURF1Q15526 300 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 GPR153Q6NV75 609 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 EEF2KMTQ96G04 330 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 UROC1Q96N76 676 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PDE11AQ9HCR9 933 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CACNG4Q9UBN1 327 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 C2CD2Q9Y426 696 aa12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NRP1O14786 923 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 AKAP3O75969 853 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ALDH2P05091 517 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 RB1P06400 928 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PSMD6Q15008 389 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ZBTB6Q15916 424 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CYP26C1Q6V0L0 522 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 NT5DC4Q86YG4 428 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FAM186BQ8IYM0 893 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 BEST2Q8NFU1 509 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 MFSD14AQ96MC6 490 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 ABHD10Q9NUJ1 306 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SPG21Q9NZD8 308 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.86□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 EPOPA6NHQ4 379 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 MAPK13O15264 365 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 FGF18O76093 207 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 DLATP10515 647 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 EPB41P11171 864 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CYP3A5P20815 502 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 KRT9P35527 623 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 CLCNKBP51801 687 aa12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
C16orf46-201ENST00000299578 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms