RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CDYLQ9Y232 598 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 COMTP21964 271 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 HMOX2P30519 316 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL2P10916 166 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP4R4Q6NUP7 873 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TNIP3Q96KP6 325 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP19Q99542 508 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TASP1Q9H6P5 420 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 B2RBV5 119 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD3O43242 534 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 WEE2P0C1S8 567 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 RRM2BQ7LG56 351 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF149Q8NC42 400 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TEKT4Q8WW24 435 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.36■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR2O60603 784 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC159P0C7I6 412 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM253P0C7T8 217 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFRAP16234 1089 aa25.35■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 FOXP3Q9BZS1 431 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 AIM2O14862 343 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D4O60343 1298 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4FQ8N1N0 589 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ERP44Q9BS26 406 aa25.35■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 ACCSLQ4AC99 568 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 NNMTP40261 264 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ACOT2P49753 483 aa25.34■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A4O43511 780 aa25.34■■□□□ 1.65
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GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ADCY3O60266 1144 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 BARGINQ6ZT62 677 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS7P49802 495 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRN2Q92932 1015 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D23Q9NUY8 699 aa25.34■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF197O14709 1029 aa25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 CNPY4Q8N129 248 aa25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPCQ03188 943 aa25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 UGP2Q16851 508 aa25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 NSL1Q96IY1 281 aa25.33■■□□□ 1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2R1Q13018 1463 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 RALAP11233 206 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CORO7P57737 925 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.33■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG6O75602 509 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 VCAM1P19320 739 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 NCOA4Q13772 614 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 COPB2P35606 906 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 STX19Q8N4C7 294 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR47O94967 919 aa25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
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