RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF169Q8NCN4 708 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT8Q92599 483 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 APBB2Q92870 758 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 LPPQ93052 612 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC42Q96M95 316 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP42Q96MM3 310 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM39AQ9NV64 488 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN5AQ14524 2016 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 EVI5O60447 810 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PRKCIP41743 596 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SCLYQ96I15 445 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 GAD1Q99259 594 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID3AQ99856 593 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 DEF6Q9H4E7 631 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.27■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL23P55773 120 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 RSAD1Q9HA92 442 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF19AQ9NV58 838 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL5CA6NH57 179 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 C9IYK1 514 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGESO14684 152 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFA10O95299 355 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP3A5P20815 502 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2C18P33260 490 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 USP8P40818 1118 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 HPDLQ96IR7 371 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 EOMESO95936 686 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO1EQ12965 1108 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.24■■□□□ 1.15
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PACSIN3-201ENST00000298838 TET1Q8NFU7 2136 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL10P02778 98 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 P4HA1P13674 534 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 DESI2Q9BSY9 194 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 AKR1B10O60218 316 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 OFD1O75665 1012 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 THP07101 528 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC175P0C221 793 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT5P13647 590 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ASPAP45381 313 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF11P52732 1056 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PTK2Q05397 1052 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CCP110O43303 1012 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ANXA13P27216 316 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM189BP81408 668 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS36Q86VN1 386 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN1AP35498 2009 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO9A1A5B4 782 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN12O43309 604 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SCNN1GP51170 649 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF560Q96MR9 790 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 KCND1Q9NSA2 647 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP26A1O43174 497 aa22.21■■□□□ 1.15
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