RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CALN1Q9BXU9 219 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TJP1Q07157 1748 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CCDC189A1A4V9 331 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 B2RBV5 119 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 VHLP40337 213 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 BLMHQ13867 455 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CASC4Q6P4E1 433 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 STK24Q9Y6E0 443 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LPXNO60711 386 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CCDC22O60826 627 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 NDUFB10O96000 172 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SMARCA1P28370 1054 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 JAM2P57087 298 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 GRAMD1BQ3KR37 738 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KRT39Q6A163 491 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DCLRE1BQ9H816 532 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 WHRNQ9P202 907 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SSTR1P30872 391 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PSMC4P43686 418 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TEX9Q8N6V9 391 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CCDC17Q96LX7 622 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PPM1 405 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CACNA2D1P54289 1103 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 UCMAQ8WVF2 138 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 NCANO14594 1321 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CLRN2A0PK11 232 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PFDN1O60925 122 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CAV1Q03135 178 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 OGFOD1Q8N543 542 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TOM1L1O75674 476 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MAP3K6O95382 1288 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SERPINB3P29508 390 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 STAT2P52630 851 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PPM1NQ8N819 430 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 E2F8A0AVK6 867 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DENND3A2RUS2 1198 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SLITRK3O94933 977 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LIG4P49917 911 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PIDD1Q9HB75 910 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CHKBQ9Y259 395 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ETS2P15036 469 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 POLD1P28340 1107 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 HIF1AQ16665 826 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 WDR78Q5VTH9 848 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LRRC6Q86X45 466 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CSRNP1Q96S65 589 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 RAD17O75943 681 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms