RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 PSMC4P43686 418 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 MTM1Q13496 603 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CUL2Q13617 745 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 IQCKQ8N0W5 287 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 BTBD19C9JJ37 291 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 P4HA2O15460 535 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 KIZQ2M2Z5 673 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ZACNQ401N2 412 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 TMC2Q8TDI7 906 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 HES6Q96HZ4 224 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SOCS7O14512 581 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SKOR1P84550 965 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 DR1Q01658 176 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CAVIN3Q969G5 261 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 FGD4Q96M96 766 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SYNCQ9H7C4 482 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 HES2Q9Y543 173 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 DOCK1Q14185 1865 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 A0A0B4J269 797 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 MAFO75444 373 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC25A27O95847 323 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 IQCF3P0C7M6 154 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 PPIL2Q13356 520 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 PPP1R7Q15435 360 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 GLRA4Q5JXX5 417 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SESTD1Q86VW0 696 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 EPN3Q9H201 632 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 YY1AP1Q9H869 796 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 GGT7Q9UJ14 662 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 EVPLQ92817 2033 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 H0YCG3 227 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 ICAM3P32942 547 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 MAP2K2P36507 400 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 PSMD6Q15008 389 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 SYT11Q9BT88 431 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 RRAGCQ9HB90 399 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 RNF14Q9UBS8 474 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAFD1-201ENST00000257604 TOM1L1O75674 476 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF699Q32M78 642 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 NLRP14Q86W24 1093 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 MDM1Q8TC05 714 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 FBXL18Q96ME1 805 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 SETD4Q9NVD3 440 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 MYPNQ86TC9 1320 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 SLCO1A2P46721 670 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 PTGISQ16647 500 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ACAD10Q6JQN1 1059 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 SCFD2Q8WU76 684 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 CABS1Q96KC9 395 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ISCUQ9H1K1 167 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 MSCO60682 206 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ATG7O95352 703 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 RFX1P22670 979 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 FNTAP49354 379 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 DYNLT1P63172 113 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 AMHR2Q16671 573 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 GDF3Q9NR23 364 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 TGFB3P10600 412 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 RFC5P40937 340 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 QPCTQ16769 361 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 IER5Q5VY09 327 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 HVCN1Q96D96 273 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAFD1-201ENST00000257604 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms