RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 RSPH10BP0C881 870 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BCAR1P56945 870 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 POU5F1BQ06416 359 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MORF4L2Q15014 288 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MEA1Q16626 185 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 APOL1O14791 398 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CHUKO15111 745 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GCLMP48507 274 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BANK1Q8NDB2 785 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TTC8Q8TAM2 541 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CYTH2Q99418 400 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSMB7Q99436 277 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HK2P52789 917 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EMC2Q15006 297 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DACT2Q5SW24 774 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 LRRC39Q96DD0 335 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RASA4BC9J798 803 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MSH4O15457 936 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RASA4O43374 803 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KDM1AO60341 852 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GPC4O75487 556 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 STOML1Q9UBI4 398 aa6.68□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CYP2D6P10635 497 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 STK4Q13043 487 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 VAT1Q99536 393 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RNF181Q9P0P0 153 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TM9SF1O15321 606 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 YY1AP1Q9H869 796 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GGA2Q9UJY4 613 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TMCC1O94876 653 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 RAD54BQ9Y620 910 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 COPEO14579 308 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ANXA9O76027 345 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CDC25AP30304 524 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 GUCY1A2P33402 732 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PCK1P35558 622 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TAF6P49848 677 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BCAT1P54687 386 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FCGRTP55899 365 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 HMGCRP04035 888 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PAEPP09466 180 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 VCAM1P19320 739 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CCNYQ8ND76 341 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 H7C4K7 107 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 ENC1O14682 589 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 EGFRP00533 1210 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CA8P35219 290 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 MAGEA9P43362 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PRKCEQ02156 737 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 FOPNLQ96NB1 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 NRCAMQ92823 1304 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 PDK1Q15118 436 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 CLUHO75153 1309 aa6.67□□□□□ -1.34
SETX-201ENST00000224140 POLBP06746 335 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms