RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-201ENST00000194530 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TCEA3O75764 348 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 VNN1O95497 513 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DSG3P32926 999 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 SCINQ9Y6U3 715 aa22.08■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 EGFRP00533 1210 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PIGRP01833 764 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 GNA15P30679 374 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 NOMO3P69849 1222 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 MAMLD1Q13495 774 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 C2CD6Q53TS8 623 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CHADLQ6NUI6 762 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ZNF365Q70YC5 407 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CCDC89Q8N998 374 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 THAP12O43422 761 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 IFNAR2P48551 515 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 WNT7BP56706 349 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 KYNUQ16719 465 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DCAF15Q66K64 600 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TMEM270Q6UE05 265 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 EXD1Q8NHP7 514 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 K7ERI5 159 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CETN2P41208 172 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DEPTORQ8TB45 409 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PORCNQ9H237 461 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.06■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 NAMPTP43490 491 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TAS2R40P59535 323 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 XRCC4Q13426 336 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TMEM143Q96AN5 459 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PTPRJQ12913 1337 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ATP2C2O75185 946 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CFHP08603 1231 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CLTAP09496 248 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PASD1Q8IV76 773 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 FUKQ8N0W3 1084 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CGRRF1Q99675 332 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 MTFR1LQ9H019 292 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 MAF1Q9H063 256 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ACAD9Q9H845 621 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PICK1Q9NRD5 415 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.05■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TMEM120BA0PK00 339 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ATP2A1O14983 1001 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 GSTA1P08263 222 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 LMNB2Q03252 620 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 RELL1Q8IUW5 271 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 C12orf42Q96LP6 360 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 ZNF302Q9NR11 478 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PARVAQ9NVD7 372 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PARP14Q460N5 1801 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 PTPRAP18433 802 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 GLRA2P23416 452 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 RXRBP28702 533 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 CCDC77Q9BR77 488 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.04■■□□□ 1.12
STRADB-201ENST00000194530 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms