RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000041730.10

Lmx1b-201, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmx1b, Length 4,790 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Shcbp1Q9Z179 668 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Usp10P52479 792 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rab6bP61294 208 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Foxo6Q70KY4 559 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ap3m2Q8R2R9 418 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rfc4Q99J62 364 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Abcg3Q99P81 650 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ube4bQ9ES00 1173 aa14.71□□□□□ -0.05
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Guca2bO09051 106 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Irf8P23611 424 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rtkn2Q14B46 604 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tab3Q571K4 716 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gpr180Q8BPS4 441 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zhx2Q8C0C0 836 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Trim47Q8C0E3 641 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 UvragQ8K245 698 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Castor1Q9CWQ8 331 aa14.71□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Kcnu1O54982 1121 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rag1P15919 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Hspa1lP16627 641 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pcyt1aP49586 367 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Nacc1Q7TSZ8 514 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Q80Y73 168 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 SftpdP50404 374 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pdp2Q504M2 532 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Heatr9Q5QNV8 569 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Nlrp4eQ66X19 978 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Zfp454Q80Y34 536 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Vmn2r43Q80Z08 845 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Abcf3Q8K268 709 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Inpp4aQ9EPW0 939 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tlr5Q9JLF7 859 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Alkbh1P0CB42 389 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 rp9P97762 213 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fam185aQ7TPD2 378 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 BrdtQ91Y44 956 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Akt1s1Q9D1F4 257 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ifi202Q9R002 445 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Mageb2A2AHM0 380 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Soat2O88908 525 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Parp3Q3ULW8 533 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 HrQ61645 1182 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Q8BGN9 141 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rhpn2Q8BWR8 686 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Slc44a4Q91VA1 707 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Psmd9Q9CR00 222 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fam111aQ9D2L9 613 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa14.7□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm29554A0A087WNW4 188 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Pde9aO70628 534 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fam8a1Q3URQ4 399 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Kcns3Q8BQZ8 491 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fbxl13Q8CDU4 790 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gga1Q8R0H9 635 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Glt1d1A4FUP9 346 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fam47eD3YWC7 402 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PurbO35295 324 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Bnip3O55003 187 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ripk2P58801 539 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ttc39bQ8BYY4 617 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Atxn7Q8R4I1 867 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Slc25a38Q91XD8 326 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Snx10Q9CWT3 201 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Tmed5Q9CXE7 229 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Fam173bQ9D1Z3 247 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Polr3cQ9D483 533 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Gm5114W4VSN8 858 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ddr1Q03146 911 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ugp2Q91ZJ5 508 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Smyd3Q9CWR2 428 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 PrameQ9D4Z5 464 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 1700011I03RikE9PYL8 271 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Vmn2r77L7N2B7 854 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Klrb1Q0ZUP1 214 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Capn13Q3UW68 665 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 CyldQ80TQ2 952 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Ddhd1Q80YA3 547 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Klhl2Q8JZP3 593 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Cd248Q91V98 765 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Prpsap1Q9D0M1 356 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Scyl3Q9DBQ7 735 aa14.69□□□□□ -0.06
Lmx1b-201ENSMUST00000041730 Rnf14Q9JI90 485 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55 ms