RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028155.11

Tsc1-201, Transcript of Hamartin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tsc1, Length 7,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm20820A0A087WPP3 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm20937A0A087WQA3 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21258A0A087WQC7 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm28102A0A087WQL3 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21095A0A087WR14 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm20792A0A087WRF5 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21865A0A087WRL2 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm28576A0A087WRP6 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm28490A0A087WRT9 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21294A0A087WS79 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm20824A0A087WS97 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21996A0A087WSS9 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm28870A0A0A6YW38 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm29866A0A0A6YX04 222 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Nmt1O70310 496 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 ChrngP04760 519 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Htr3aP23979 487 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Anxa5P48036 319 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 PighQ5M9N4 188 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm21627Q810R0 219 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 TiprlQ8BH58 271 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Zbtb33Q8BN78 671 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Cep95Q8BVV7 827 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Vps50Q8CI71 964 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Mrgprx1Q8CIP3 322 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Chn1Q91V57 459 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ercc4Q9QZD4 917 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Copg1Q9QZE5 874 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Atp10aO54827 1508 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Chil3O35744 398 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Cd86P42082 309 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tbx1P70323 479 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Znf569Q80W31 679 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Psmd5Q8BJY1 504 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Q8BP99 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 RbakQ8BQC8 711 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Olfr474Q8VFC9 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Elp3Q9CZX0 547 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gpr63Q9EQQ3 425 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Trpv2Q9WTR1 756 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Peg12Q9WVA7 283 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Zfp882E9Q4R4 555 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Farp1F8VPU2 1048 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm379J3QQ19 296 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Eef2kO08796 724 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ctnnal1O88327 731 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 CraddO88843 199 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Kank2Q8BX02 843 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tesk2Q8VCT9 570 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Fis1Q9CQ92 152 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 GrapQ9CX99 217 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Angptl2Q9R045 493 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Abcc3B2RX12 1523 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Serpinb2P12388 415 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Celf1P28659 486 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Pcsk1P63239 753 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 FancbQ5XJY6 703 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ddr2Q62371 854 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tas2r131Q7M708 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Catsper3Q80W99 395 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Zfp566Q8VCI1 386 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tada1Q99LM9 335 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 XpotQ9CRT8 963 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm3424L7N298 263 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm8246M0QWX9 263 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Krt31Q61765 416 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Apol9bQ8C7I4 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Zfp263Q8CF60 680 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Apol9aQ8VDU3 310 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Snx9Q91VH2 595 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Map3k6Q9WTR2 1291 aa9.5□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ism1A2ATD1 454 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Olfr67F8VPJ8 320 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Nr1i3O35627 358 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Nfe2Q07279 373 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tmem117Q8BH18 514 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ticam2Q8BJQ4 232 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Hebp1Q9R257 190 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Osbpl9A2A8Z1 736 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Trappc11B2RXC1 1133 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Gm2832F7AEC7 200 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Clk2O35491 499 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Zmym6Q8BS54 1249 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Hat1Q8BY71 416 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Btbd7Q8CFE5 1130 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Actl9Q8CG27 415 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Uggt2E9Q4X2 1504 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Ppm1aP49443 382 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Mxi1P50540 228 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Tspan3Q9QY33 253 aa9.49□□□□□ -0.89
Tsc1-201ENSMUST00000028155 Rhbdl2A2AGA4 302 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.9 ms