RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 DCTN3O75935 186 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 GZMAP12544 262 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 RASA3Q14644 834 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 SLC1A5Q15758 541 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 FOXB2Q5VYV0 432 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 NRG4Q8WWG1 115 aa21.79■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 FAM196BA6NMK8 535 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 ABLIM1O14639 778 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 IL1R1P14778 569 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 STAT4Q14765 748 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 WDR18Q9BV38 432 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 GAS8O95995 478 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 GYS1P13807 737 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 MFN1Q8IWA4 741 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 AKT1S1Q96B36 256 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.78■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 MUTP22033 750 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 VAMP7P51809 220 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 PDK4Q16654 411 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 CCDC125Q86Z20 511 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 IFT43Q96FT9 208 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 TRABDQ9H4I3 376 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 UBE4BO95155 1302 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 SMAPO00193 183 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 SPARCL1Q14515 664 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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PMS1-222ENST00000639501 GALNT15Q8N3T1 639 aa21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PMS1-222ENST00000639501 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CIITAP33076 1130 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MAGEA4P43358 317 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 TLE6Q9H808 572 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 NPHS2Q9NP85 383 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CYLDQ9NQC7 956 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 PTPN4P29074 926 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ALDH3A1P30838 453 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZNF76P36508 570 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RPS6KA3P51812 740 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CAV1Q03135 178 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 STRA6Q9BX79 667 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 DCLRE1BQ9H816 532 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 WDR35Q9P2L0 1181 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.76■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 KRT36O76013 467 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 CYP11B1P15538 503 aa21.75■■□□□ 1.07
PMS1-222ENST00000639501 MARK3P27448 753 aa21.75■■□□□ 1.07
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