RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 ASIC2Q16515 512 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ABCB6Q9NP58 842 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MCL1Q07820 350 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 LPIN1Q14693 890 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GPD1LQ8N335 351 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CITO14578 2027 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SELPP16109 830 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SEZ6Q53EL9 994 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 NOX5Q96PH1 765 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CDT1Q9H211 546 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ALPK3Q96L96 1907 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TET1Q8NFU7 2136 aa21.49■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 AXLP30530 894 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CD52P31358 61 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ACOT2P49753 483 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 APBA1Q02410 837 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 KLHL30Q0D2K2 578 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MBTPS1Q14703 1052 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PADI3Q9ULW8 664 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 L1RE1Q9UN81 338 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ANK1P16157 1881 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PITPNM1O00562 1244 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GPR182O15218 404 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZNF185O15231 689 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 EXTL3O43909 919 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SLC18A3Q16572 532 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 NOTUMQ6P988 496 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 BORCS6Q96GS4 357 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FBXL18Q96ME1 805 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HIPK3Q9H422 1215 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.48■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ADRB2P07550 413 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PAK2Q13177 524 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SQORQ9Y6N5 450 aa21.47■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 OGTO15294 1046 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FAM189A1O60320 539 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PON1P27169 355 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ITIH3Q06033 890 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GBP6Q6ZN66 633 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CREG2Q8IUH2 290 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CEP120Q8N960 986 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 USP38Q8NB14 1042 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZNF233A6NK53 670 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 NPTXRO95502 500 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 CLTBP09497 229 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MCF2P10911 925 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 UCHL3P15374 230 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SLC9A1P19634 815 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TNFSF9P41273 254 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 OSTNP61366 133 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GPS2Q13227 327 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SLC35C1Q96A29 364 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 SPAG5Q96R06 1193 aa21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms