RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SP9P0CG40 484 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TXKP42681 527 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NTHL1P78549 312 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXQ1Q9C009 403 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SIT1Q9Y3P8 196 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 VWA8A3KMH1 1905 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087X0B3 334 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGESO14684 152 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM12O43184 909 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD6P59095 220 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 POSTNQ15063 836 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PARM1Q6UWI2 310 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD17Q8N5Z5 321 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF4AO95239 1232 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GPC5P78333 572 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PDILTQ8N807 584 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PJA1Q8NG27 643 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HASPINQ8TF76 798 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PIK3R5Q8WYR1 880 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX58Q96C10 678 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PANK2Q9BZ23 570 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP2Q9UGN5 583 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.829e-10■■■■□ 24.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH6O60337 910 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC2O95347 1197 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FSHRP23945 695 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP12P59046 1061 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TUSC3Q13454 348 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 RRAGBQ5VZM2 374 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 HACE1Q8IYU2 909 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE5Q96GU1 130 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 FZD8Q9H461 694 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 TADA2AO75478 443 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 EDN1P05305 212 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CREMQ03060 361 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH7Q9ULB5 785 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOR2Q9Y618 2525 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-216ENST00000628306 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HYIQ5T013 277 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CALML4Q96GE6 196 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 GSDMAQ96QA5 445 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 TTPALQ9BTX7 342 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZD7Q9H5P4 517 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX1P22670 979 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM187BQ17R55 369 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT79Q5XKE5 535 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEHQ6S545 545 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA2013Q8IYS2 634 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SUMF1Q8NBK3 374 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ITFG1Q8TB96 612 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 BSNDQ8WZ55 320 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF13Q92913 245 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 STK17AQ9UEE5 414 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA9P31269 272 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 STAT6P42226 847 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF165P49910 485 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PNOCQ13519 176 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD5Q16401 504 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCE1Q969G3 411 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 SNTG2Q9NY99 539 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 USP20Q9Y2K6 914 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 MIA3Q5JRA6 1907 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 PATJQ8NI35 1801 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 C8AP07357 584 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC25AP30304 524 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms