RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	SYN3	O14994	580 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	GRIN1	Q05586	938 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	MCM6	Q14566	821 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	RTL10	Q7L3V2	364 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	RAD54L	Q92698	747 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	POU2F2	P09086	479 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	CLTA	P09496	248 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	CXCL8	P10145	99 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	CLCN5	P51795	746 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	KYAT1	Q16773	422 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	SIX5	Q8N196	739 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	KCNN1	Q92952	543 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568		H7C4K7	107 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	ABCD1	P33897	745 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	MCM4	P33991	863 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	LRRC15	Q8TF66	581 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	CDH7	Q9ULB5	785 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	TBX20	Q9UMR3	447 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TCF4-259	ENST00000627568	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TRAK2	O60296	914 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CFH	P08603	1231 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SRF	P11831	508 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	RFX1	P22670	979 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ELF1	P32519	619 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF131	P52739	623 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	NTHL1	P78549	312 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ROR1	Q01973	937 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	WNT16	Q9UBV4	365 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	HTR4	Q13639	388 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	KIF12	Q96FN5	646 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SUSD3	Q96L08	255 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ANHX	E9PGG2	379 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PIGR	P01833	764 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ARPP19	P56211	112 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF280D	Q6N043	979 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	APPL2	Q8NEU8	664 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PHOX2B	Q99453	314 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CLIC4	Q9Y696	253 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TTC26	A0AVF1	554 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	PRRG1	O14668	218 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	OGT	O15294	1046 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	LRG1	P02750	347 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	AOC1	P19801	751 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TXLNA	P40222	546 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MTSS1L	Q765P7	747 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	FGF13	Q92913	245 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	WDR27	A2RRH5	827 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568		H0Y858	1186 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	STK25	O00506	426 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SYT1	P21579	422 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	TNFSF9	P41273	254 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	SPAG1	Q07617	926 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	REST	Q13127	1097 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CA14	Q9ULX7	337 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	ABLIM3	O94929	683 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	NPR3	P17342	541 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	CYP3A5	P20815	502 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	LRPAP1	P30533	357 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	DDIT3	P35638	169 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TCF4-259	ENST00000627568	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06

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