RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf170-201ENST00000623052 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.21□□□□□ -0.13
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C9orf170-201ENST00000623052 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MGARPQ8TDB4 240 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
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C9orf170-201ENST00000623052 TMEM143Q96AN5 459 aa14.21□□□□□ -0.13
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C9orf170-201ENST00000623052 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.21□□□□□ -0.13
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