RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 THAP12O43422 761 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 APBA3O96018 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 IL9RQ01113 521 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RAPH1Q70E73 1250 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KCNK18Q7Z418 384 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SLF2Q8IX21 1173 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TIAM2Q8IVF5 1701 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB5O43674 189 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ECE2O60344 883 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC6O75061 913 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RAD17O75943 681 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ATP5HO75947 161 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TFPTP0C1Z6 253 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 POTEJP0CG39 1038 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RARGP13631 454 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CETN2P41208 172 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3CAP42336 1068 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CDK8P49336 464 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB16Q05516 673 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STRN3Q13033 797 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LPCAT4Q643R3 524 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf80Q86SX3 495 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DDX12PQ92771 950 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CEP95Q96GE4 821 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RAB34Q9BZG1 259 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GANQ9H2C0 597 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 AAASQ9NRG9 546 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L15C9J2P7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L11C9JVI0 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L18D6R9N7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L22D6RA61 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L19D6RCP7 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L20D6RJB6 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MEIS1O00470 390 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CES2O00748 559 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DCTN3O75935 186 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LDHCP07864 332 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC166P0CW27 439 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 DSG1Q02413 1049 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L24Q0WX57 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 KCNH2Q12809 1159 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CDC16Q13042 620 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 TREML1Q86YW5 311 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 C10orf82Q8WW14 230 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF653Q96CK0 615 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ECSITQ9BQ95 431 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SYNCQ9H7C4 482 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PAPPAQ13219 1627 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CDK4P11802 303 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 PCSK6P29122 969 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 GSTO1P78417 241 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 CALCOCO2Q13137 446 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MOGSQ13724 837 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RASSF3Q86WH2 238 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 RIN3Q8TB24 985 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD8Q96I13 439 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 NYXQ9GZU5 481 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEF1Q9HAY2 307 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 STK32BQ9NY57 414 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-211ENST00000618610 HEY2Q9UBP5 337 aa8.68□□□□□ -1.02
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