RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LCA5L	O95447	670 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KIT	P10721	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EMC2	Q15006	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HYI	Q5T013	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	E2F8	A0AVK6	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CREB1	P16220	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PFAS	O15067	1338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CIITA	P33076	1130 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	OVGP1	Q12889	678 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	STXBP2	Q15833	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MIS12	Q9H081	205 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PGM5	Q15124	567 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CROCCP2	Q86T23	111 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	BANF1	O75531	89 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GGPS1	O95749	300 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CDC25C	P30307	473 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	SFN	P31947	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CHKA	P35790	457 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KAT2B	Q92831	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	TULP2	O00295	520 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.52	□□□□□ -0.24
ACSS3-208	ENST00000616449	DGAT1	O75907	488 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	INHBA	P08476	426 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	MSH2	P43246	934 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	DAW1	Q8N136	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	CHUK	O15111	745 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	PGK2	P07205	417 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	SCTR	P47872	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	RUBCN	Q92622	972 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ACSS3-208	ENST00000616449	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms