RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TMEM237Q96Q45 408 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 GPR88Q9GZN0 384 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TRABDQ9H4I3 376 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TMX2Q9Y320 296 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 O00370 1275 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 HLA-DRAP01903 254 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 CHRNB2P17787 502 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MAN1A1P33908 653 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 COPS2P61201 443 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 OVGP1Q12889 678 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 GPD1LQ8N335 351 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 BORCS6Q96GS4 357 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 NINJ2Q9NZG7 142 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 KCND2Q9NZV8 630 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 K7ERI5 159 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 RGL2O15211 777 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ASAP2O43150 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 PDHA1P08559 390 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 VPS52Q8N1B4 723 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 AGAP11Q8TF27 550 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 IDI2Q9BXS1 227 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 CALN1Q9BXU9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 GINM1Q9NU53 330 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 HAO1Q9UJM8 370 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 FEM1BQ9UK73 627 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ASNSP08243 561 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 BPIFB4P59827 614 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SPOCK2Q92563 424 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ENTPD3O75355 529 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SPP2Q13103 211 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SPARCL1Q14515 664 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ITIH4Q14624 930 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 MORC4Q8TE76 937 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SERPINB12Q96P63 405 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 DMAC2Q9NW81 257 aa14.65□□□□□ -0.06
HPS1-215ENST00000613394 UBE4BO95155 1302 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CFAP73A6NFT4 308 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 YY1AP1Q9H869 796 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 NPHS2Q9NP85 383 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PIK3R2O00459 728 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 BANF1O75531 89 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 BBOF1Q8ND07 529 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ART4Q93070 314 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CNKSR1Q969H4 720 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 COL20A1Q9P218 1284 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 PEX5P50542 639 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 CYP4X1Q8N118 509 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms