RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDC25CP30307 473 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VAMP7P51809 220 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FMO1Q01740 532 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDR2Q01850 454 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP3CAQ08209 521 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP2R5CQ13362 524 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CUL3Q13618 768 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RASA3Q14644 834 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DLGAP5Q15398 846 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 QRICH1Q2TAL8 776 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GNPTABQ3T906 1256 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EFHC2Q5JST6 749 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC25Q86WR0 208 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC125Q86Z20 511 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARHGEF19Q8IW93 802 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OGFOD1Q8N543 542 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYCT1Q8N699 235 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STKLD1Q8NE28 680 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTC8Q8TAM2 541 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NRG4Q8WWG1 115 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC5A5Q92911 643 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NACC1Q96RE7 527 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HAPLN3Q96S86 360 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IWS1Q96ST2 819 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MIPEPQ99797 713 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NUP85Q9BW27 656 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRABDQ9H4I3 376 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM206Q9H813 350 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PIDD1Q9HB75 910 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD209Q9NNX6 404 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHST7Q9NS84 486 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BTG4Q9NY30 223 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NYAP2Q9P242 653 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLAIN2Q9P270 581 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NARFQ9UHQ1 456 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 POLIQ9UNA4 740 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTMR7Q9Y216 660 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TAF1LQ8IZX4 1826 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EMSYQ7Z589 1322 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L15C9J2P7 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L11C9JVI0 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L18D6R9N7 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L22D6RA61 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L19D6RCP7 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP17L20D6RJB6 530 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM86B1E9PN63 330 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMAPO00193 183 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MEIS1O00470 390 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KLF11O14901 512 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TM9SF1O15321 606 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLDN3O15551 220 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAP3K13O43283 966 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSTPIP1O43586 416 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms